职称/职务

副教授

导师类型

硕士生导师

联系电话

13508163593

电子邮箱

chensysau@163.com

研究方向

牛、兔分子遗传与育种

学术、技术组织任职/头衔

四川省学术和技术带头人后备人选

受教育及

工作经历

教育经历：

1.2004.09 – 2009.06四川农业大学博士

2.2000.09 – 2004.06四川农业大学大学本科

工作经历：

1.2010.07 –至今澳门新葡澳京官网

2.2009.07 – 2010.06中国科学院昆明动物研究所

教学课程

畜禽资源评价与利用

人才培养情况

共培养硕士研究生2余人，在读硕士研究生人4人

科研项目

（近五年）

1.牛生殖道微生物菌群结构及其与受胎率的相关性研究.四川省科技厅国际合作项目. 2018年-2020年

2.农区肉牛产业技术研发与集成应用.四川肉牛创新团队. 2017年-2022年

代表性论文

（1）Shi-Yi Chen*,#, Cao Li#, Xianbo Jia, Song-Jia Lai*. Sequence and evolutionary features for the alternatively spliced exons of eukaryotic genes. International Journal of Molecular Sciences, 2019, 20(15), 3834.

（2）Shi-Yi Chen#, Feilong Deng#, Xianbo Jia, Hanzhong Liu, Gong-Wei Zhang, Song-Jia Lai*. Gut microbiota profiling with differential tolerance against the reduced dietary fibre level in rabbit. Scientific Reports, 2019, 9: 288.

（3）Shi-Yi Chen#,*, Linhai Liu#, Maozhong Fu, Gong-Wei Zhang, Jun Yi, Song-Jia Lai, Wei Wang*. Simultaneous introgression of three POLLED mutations into a synthetic breed of Chinese cattle. PLoS ONE, 2017, 12(10): e0186862.

（4）Shi-Yi Chen#,*, Feilong Deng#, Xianbo Jia, Cao Li, Song-Jia Lai*. A transcriptome atlas of rabbit revealed by PacBio single-molecule long-read sequencing. Scientific Reports, 2017, 7: 7648.

（5）Shi-Yi Chen*, Qin Liu, Zhe Feng*. Common data manipulations with R in biological researches. Journal of Thoracic Disease, 2017, 9(7): 2209-2213 (Invited Review).

（6）Shi-Yi Chen*, Zhe Feng, Xiaolian Yi. A general introduction to adjustment for multiple comparisons. Journal of Thoracic Disease, 2017, 9(6): 1725-1729 (Invited Review).

（7）Feilong Deng, Shi-Yi Chen, Zhou-Lin Wu, Yongsong Hu, Xianbo Jia, Song-Jia Lai*. GFFview: a web server for parsing and visualizing annotation information of eukaryotic genome. Journal of Computational Biology, 2017, 24(10): 1060-1064.

（8）Shi-Yi Chen#,*, Feilong Deng#, Ying Huang, Cao Li, Linhai Liu, Xianbo Jia, Song-Jia Lai*. PopSc: computing toolkit for basic statistics of molecular population genetics simultaneously implemented in web-based calculator, Python and R. PLoS ONE, 2016, 11(10): e0165434.

（9）Shi-Yi Chen#,*, Feilong Deng#, Ying Huang, Xianbo Jia, Yi-Ping Liu, Song-Jia Lai. bioOTU: an improved method for simultaneous taxonomic assignments and operational taxonomic units clustering of 16s rRNA gene sequences. Journal of Computational Biology, 2016, 23(4): 1-10.

（10）Feilong Deng, Shi-Yi Chen*. dbHT-Trans: an efficient tool for filtering the protein-encoding transcripts assembled by RNA-Seq according to search for homologous proteins. Journal of Computational Biology, 2016, 23(1): 1-9.

各类获奖

家兔SNP标记辅助选择育种新方法构建与示范.四川省科技进步奖二等奖. 2014年，排名第二

专利、新品种、教材、专著等

专利：

2015年，肉牛饲料配方系统V1.0，计算机软件著作权，登记号：1126071

社会服务

肉牛养殖技术服务